El ácido cítrico es un ácido orgánico que se utiliza a menudo para la eliminación de incrustación de carbonato de calcio e hidróxido de hierro. El ácido cítrico no es muy eficaz en la remoción de sales de fosfato, tales como fosfatos de calcio e hierro. No puede ser utilizado para disolver las incrustaciones de sulfato o sílice, y es ineficaz para la eliminación de biofilm.

Aunque a menudo se recomienda para la eliminación de compuestos orgánicos, no es muy eficaz debido a la protonación de los grupos funcionales de ácido carboxílico en la materia orgánica natural (NOM) en el entorno de bajo pH creado por el ácido cítrico. Por esta razón, intentar limpiar a pH bajo cuando hay compuestos orgánicos puede compactar el NOM en la membrana, dando como resultado una impureza que es más difícil de limpiar, o incluso irreversible.

Ciertos agentes anti-aglomerantes presentes en el ácido cítrico pueden actuar como ensuciantes de membrana y, por lo tanto, siempre es más seguro utilizar productos químicos de limpieza especializados para OI. Además, en los Estados Unidos, los precios del ácido cítrico se han inflado debido a los impuestos anti-dumping impuestos a las importaciones. Por esta razón, tiene poco sentido utilizar el ácido cítrico en lugar de productos químicos de limpieza especializados que son más eficaces en un más amplio espectro y son de un costo similar.