在以下条件下，RO（反渗透）阻垢剂可在反渗透系统中引起膜污染：
- RO（反渗透）阻垢剂中的真菌生长 – 一些阻垢剂含有杂质，可以为生物生长提供必要的营养和碳。在基于聚合物的阻垢剂中发现真菌生长并不罕见。桶中的生长物可以在膜表面上生长。信誉良好的制造商生产更高纯度的产品，并使用NSF认可的抗真菌防腐剂来预防这些问题。
- RO（反渗透）阻垢剂添加点太接近酸添加点 – 通常使用浓硫酸调节pH。在没有良好混合的情况下，由于其相对于水的非常高的密度，酸将暂时形成单独的相。如果在加入酸之后立即给予阻垢剂，则它可以被强酸水解。某些基于聚合物的阻垢剂非常容易发生这种降解。
- 与水质不相容 – 一些RO（反渗透）阻垢剂对铁和铝没有良好的耐受性。这些阻垢剂将与这些金属形成不溶性复合物并在RO（反渗透）膜表面上沉淀。
- 非常高的硬度或非常高的RO（反渗透）阻垢剂剂量 – 阻垢剂比典型的成垢阴离子（如碳酸盐或磷酸盐）携带更高的负电荷; 所以他们对钙和镁有很强的吸引力。在阈值抑制期间，对钙/镁的这种吸引导致吸附形成簇，并干扰稳定核的形成。当硬度浓度非常高时，阻垢剂本身可形成不溶的钙 – 阻垢剂盐。这显然成了一个问题，因为一旦活性抑制剂沉淀，其他垢也会沉淀。无论是基于聚合物还是膦酸基的阻垢剂，硬度将会影响所有阻垢剂。AWC的Proton阻垢剂预测软件可以预测这种盐的形成，因此可以预测在给定温度和pH下的最大回收率。
- 质量控制问题 – 在某些情况下，生产不当造成的问题会导致某些基于聚合物的阻垢剂在膜表面形成不溶性凝胶。因此，必须使用信誉良好的供应商所提供的RO（反渗透）阻垢剂。